Περιεχόμενο

• Περιεχόμενο: Διαφορά μεταξύ βιβλιοθήκης γονιδιώματος και βιβλιοθήκης cDNA
• Συγκριτικό διάγραμμα
• Τι είναι η Genomic Library;
• Τι είναι η βιβλιοθήκη cDNA;
• Βασικές διαφορές

Η γονιδιωματική βιβλιοθήκη και η βιβλιοθήκη cDNA χρησιμοποιούνται αμφότερα στην κλωνοποίηση γονιδίων για την απομόνωση διαφορετικών DNA. Η διαφορά μεταξύ των δύο αυτών βιβλιοθηκών είναι ότι η γονιδιωματική βιβλιοθήκη περιλαμβάνει θραύσματα ϋΝΑ τα οποία εκφράζουν ολόκληρο το γονιδίωμα ενός οργανισμού ενώ στη βιβλιοθήκη cDNA, το mRNA λαμβάνεται από συγκεκριμένα κύτταρα ενός οργανισμού και κατόπιν το cDNA αποτελείται από αυτό το mRNA σε μια αντίδραση που καταλύεται από ένα ένζυμο.

Περιεχόμενο: Διαφορά μεταξύ βιβλιοθήκης γονιδιώματος και βιβλιοθήκης cDNA

• Συγκριτικό διάγραμμα
• Τι είναι η Genomic Library;
• Τι είναι η βιβλιοθήκη cDNA;
• Βασικές διαφορές

Συγκριτικό διάγραμμα

Τι είναι η Genomic Library;

Στη διαδικασία κλωνοποίησης γονιδίων, το γονίδιο που ενδιαφέρει αντιγράφεται από DNA που έχει διαχωριστεί από έναν οργανισμό. Όταν το DNA διαχωρίζεται από έναν οργανισμό, τα γονίδια του έχουν εξαχθεί ταυτόχρονα. Το DNA του οργανισμού περιλαμβάνει χιλιάδες διαφορετικά γονίδια. Ο γενετικός μηχανικός βρίσκει ένα συγκεκριμένο γονίδιο που κωδικοποιεί τη συγκεκριμένη πρωτεΐνη που μας ενδιαφέρει.

Δεν υπάρχει απολύτως καμία μέθοδος με την οποία είναι διαθέσιμο ένα συγκεκριμένο γονίδιο από το DNA, έτσι ώστε οι επιστήμονες κάνουν τις βιβλιοθήκες γονιδίων να κατατάσσουν το DNA του οργανισμού. Οι επιστήμονες, στη συνέχεια, επιλέξτε το επιθυμητό γονίδιο στη βιβλιοθήκη. Η γονιδιακή βιβλιοθήκη είναι μια ομάδα ζωντανών βακτηριακών αποικιών που έχουν μεταμορφωθεί με μοναδικά κομμάτια DNA στον οργανισμό που είναι η προέλευση του επιθυμητού γονιδίου. Το DNA εξάγεται από έναν οργανισμό για να δημιουργήσει μια βιβλιοθήκη που είναι μια οργανωμένη μορφή DNA. Η γονιδιωματική βιβλιοθήκη και το cDNA είναι δύο είδη γονιδιακών βιβλιοθηκών. Πολυάριθμες τεχνικές κλωνοποίησης γονιδίων έχουν χρησιμοποιηθεί ως στρατηγικές γονιδίων σε τεχνολογία ανασυνδυασμού.

Τα θραύσματα ϋΝΑ διαχωρίζονται με κοπή με συγκεκριμένα περιοριστικά ένζυμα από γονικό DNA. Αυτά τα θραύσματα συνδέονται με μόρια φορέα και τα συσσωρευμένα μόρια μετακινούνται σε κύτταρα ξενιστές, 1 μόριο σε κάθε κύτταρο. Η γονιδιωματική βιβλιοθήκη αποτελείται από ιντρόνια, σκουριασμένο DNA και πολλά άλλα θραύσματα. Μέσα σε αυτήν τη βιβλιοθήκη, το DNA διασπάται σε μικρότερα θραύσματα μέσα σε ένα κελί. Μετά από αυτό, όλα τα μικρά μέρη εισάγονται σε έναν φορέα για να δημιουργηθεί μια βιβλιοθήκη. Η γονιδιωματική βιβλιοθήκη περιλαμβάνει όλο το DNA όλων των γονιδίων και το κύτταρο αποτελείται από όλα τα ιντρόνια τους. Το γονιδιωματικό DNA είναι η μετάφραση ολόκληρου του γονιδιώματος. Δεν κωδικοποιεί ολόκληρο το τμήμα σε ένα κωδικόνιο λόγω του μεγέθους των εσωνίων. Δεν υπάρχει μηχανισμός ματίσματος σε γονιδιωματική βιβλιοθήκη που προκαλεί δυσκολία στην έκφραση γονιδίων που λαμβάνονται από αυτή τη βιβλιοθήκη.

Τι είναι η βιβλιοθήκη cDNA;

Η βιβλιοθήκη cDNA κατασκευάζεται επιλέγοντας έναν τύπο ιστού ή κυττάρου. Στη συνέχεια απομονώνεται το mRNA από αυτόν τον ιστό ή κύτταρο. Ένα αντίγραφο DNA του μορίου mRNA αποτελείται από ένζυμο ειδικής ενζύμου αντίστροφης μεταγραφάσης. Έτσι, η βιβλιοθήκη cDNA περιέχει αυτό το ειδικό DNA που υπάρχει στο mRNA. Δεν υπάρχουν ιντρόνια και καμία ακολουθία DNA σε αυτή τη βιβλιοθήκη. Μέσα σε αυτήν τη βιβλιοθήκη, όλοι οι κλώνοι είναι πλήρους μήκους. Περαιτέρω, ένας κλώνος cDNA είναι απαραίτητος για τη διαμόλυνση κυττάρων για παραγωγή πρωτεΐνης ή για προσδιορισμούς βασισμένους σε κύτταρα.

Βασικές διαφορές

1. Η γενωμική βιβλιοθήκη γράφτηκε απευθείας από το γενωμικό DNA.
2. Βιβλιοθήκη cDNA σχηματίστηκε χρησιμοποιώντας mRNA ως πρότυπο.
3. Η γονιδιωματική βιβλιοθήκη καταλαμβάνει ολόκληρο το γονιδίωμα αυτού του οργανισμού.
4. Η βιβλιοθήκη cDNA αντιπροσωπεύει μόνο γονίδια συγκεκριμένων παθήσεων.
5. Δύο ένζυμα, περιοριστικές ενδονουκλεάσες και λιγάσες είναι σημαντικές για την κατασκευή γονιδιωματικής βιβλιοθήκης.
6. Το ένζυμο αντίστροφης μεταγραφάσης παίζει σημαντικό ρόλο στην κατασκευή βιβλιοθήκης cDNA.
7. Η γονιδιωματική βιβλιοθήκη καταλαμβάνει το DNA τόσο των προκαρυωτικών όσο και των ευκαρυωτικών οργανισμών.
8. Η βιβλιοθήκη cDNA αντιπροσωπεύει το ϋΝΑ απλώς ευκαρυωτικών οργανισμών.
9. Η βιβλιοθήκη cDNA είναι ικανή έκφρασης γονιδιώματος σε βακτήρια που είναι προκαρυωτικά δεδομένου ότι στερούνται ιντρονίων.
10. Μια γονιδιωματική βιβλιοθήκη δεν είναι ικανή να λέει στον προκαρυωτικό οργανισμό επειδή έχει ιντρόνια και ο προκαρυωτικός οργανισμός δεν διαθέτει μηχανές για να επεξεργάζεται ιντρόνια.